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분말 키토산(chitosan)을 용해탱크에 일정량 투입하고 물과 유기산(젖산, 초산등)을 첨가한 후 용해탱크를 가동한다. 용해가 완료되면 견본을 채취하여 점도를 확인하고 펌프를 가동하여 효소반응기로 이송한다. 효소반응기의 조정판을 작업표준에 따라 조정하고 효소를 첨가하여 효소반응기를 작동시킨다. 효소반응기 내부의 온도, 시간, pH 등을 수시로 점검하여 발효가 정상적으로 이루어지는지를 살핀다. 반응이 완료되면 펌프를 가동하여 여과막과살균기를 통과시키고 농축기로 이송한다. 농축도를 검사하여 일정한 농도의 키토산올리고당(키틴과 키토산을 가수분해하여 분자크기를 작게 만든 것)이 완성되면 건조과정을 거친 후 저장실로 이송하고 견본을 채취하여 실험실로 보낸다.